سلام
من هم به همین مشکل برخوردم و از همین آدرس /plugins/system/jat3/base-themes/default/images/favicon.ico فایل رو تغییر دادم
ولی نکته ای که لازم هست برای نمایش آیکن جدید روی سایت آنلاین انجام بشه اینه که
سایت رو باز کنید و جلوی آدرس سایت همین مسیر رو اضافه کنین
بعد که آیکن جوملا نمایش داده شد، کنترل F5 رو بزنید
بعد دوباره سایت رو امتحان کنید
میبینید که مشکل حل شده
