با سلام
بهترین روش که به نظر من می رسه، این که قالب خود را با DIV طراحی کنید، و در صورتی که کاربر زبان فارسی (RTL) را انتخاب کرد، بعد از css/css_template.css یک css دیگه بارگذاری کنید به این صورت css/rtl.css و در این CSS شما تعریف کنید کجا ها RTL بشه.
البته تنها یک نظر بود، باید با توجه به افکار خودتون سعی به ایجاد چنین چیزی کنید،‌ من بودم چنین کاری می کردم


موفق و پیروز باشید
یا علی