امیر جان یه کاری کن شما :
کد جاوا اول رو ، توی یک فایل js ذخیره کن
بعد :
کد:
echo "<script language='JavaScript' type='text/javascript' src='masire zakhire shode file js'></script>";
رو بعد از بسته شدن تگ head بذار . البته چک کن اینو توی یک echo دیگه نذاری

یا علی