شما دو راه حل دارید
۱- لینوکس نصب کنید.
۲- روی سرور ویندوزی به جای IIS از APACHI استفاده کنید.

برای کنترل پنل هم اصلا مشکلی ندارید. چون کنترل پنل وقتی نیازش خیلی احساس میشه که به سرور دسترسی ندارید.
وقتی سرور دم دست شماست و فقط شما ازش استفاده میکنید میتونید تمام تنظیمات رو از روی کنسول انجام بدید!