به نظر من مشکل از سایت شما نیست.
توی سایت شما ریدایرکتی اصلا روی index.php انجام نمیشه که بگیم مشکل از اون هست.
به نظر من مشکل از گوگل هست.

برای سایت من مثلا 5 تا از آدرس ها رو زده که not found هستند:
[مهمان/کاربر گرامی برای دیدن لینک ها ابتدا باید عضو سایت شوید و لاگین کنید برای ثبت نام اینجا کلیک کنید]
[مهمان/کاربر گرامی برای دیدن لینک ها ابتدا باید عضو سایت شوید و لاگین کنید برای ثبت نام اینجا کلیک کنید]
که هر دو کاملا بی ربط هستند چون همچین آدرس هایی اصلا وجود نداره توی سایت من.
توی آدرس اول من یه روزی photoshop رو اشتباه به صورت poshop تایپ کردم و حالا گوگل هنوز که هنوزه گیر داده و اونو با همه چیز قاطی می کنه و میگه وجود نداره.
در مورد آدرس دوم هم من اصلا از sef مامبو استفاده نمی کنم. در حالی که نصف آدرس، آدرس sh404sef هست و نصف دیگه ی اون از sef مامبو که قبلا روی سایت فعال بوده و گوگل هر از چند گاهی یه مشت از این آدرس های بی ربط رو به من میده و میگه not found!!!!!!
و باز چند روز میگذره یه مشت آدرس حذف میشن و یه مشت جدید اضافه میشن.

در مورد سایت شما هم فکر می کنم موقعی که sh404sef رو نصب کرده بودی آدرس هات روی index.php ریدایرکت می شد؟ درسته؟ (درست یادم نیست)
که فکر کنم گوگل سر همون جو گرفتتش الگی گیر میده.