شما میتونید یک کلاس css به موقعیتتون نسبت بدید و از اون طریق درستش کنید. مثلا:
کد:
<div id="rightpos">
   <?php mosLoadModules ( 'right' ); ?>
</div>
که موقعیت ماژول right رو به کلاس rightpos در فایل css نسبت داده.