ابراهیم جان بعید میدونم فقط فایل های ایندکس آلوده شده باشه
معمولا فایلهای دیگه و حتی فایل های جاوا اسکریپت هم آلوده میشن. توصیه میکنم کامل بررسی و چک کنید

یاعلی