اگر وی پی اس شما لینوکس هست فکر کنم مشکلتون این باشه
شما وقتی فایل زیپ رو با کاربر root ان زیپ کنی اون فایل فقط توسط root قابل نوشتن و تغییر هست
شما باید اس ام اف رو خودت با kloxo آن زیپ کنی