سلام
نیاز نیست شما فایلی را به جایی منتقل کنید اگر بسته ای که میخواهید نصب کنید سالم باشد کافیست از خود جوملا اقدام به نصب کنید

فقط باید پوشه هایی که نیاز است را تغییر پرمشین دهید البته بستگی به سرور شما دارد

مثلا اگر ماژول هست پوشه های
administrator/modules
modules/
tmp
log
cache
و اگر پلاگین هست
plugins فولدرهای داخلش
و ...

در این خصوص در انجمن مقالات و مطالب مفصلی وجود دارد