هک شدن remository و ارور Internal Server Error در آن

[guilanclick]

سلام وقت بخیر
اول باید تشکر کنم از سایت خوبتون
سایت من توسط یک سایت عربی هفته ی گذشته هک شد!
هر صفحه از سایت رو باز می کردن یک پیج به زبان عربی باز می شد.
حدس می زنم کاری که انجام داده بودند این بود که از طریق مرکز دانلود یک فایل شل آپلود کرده بودند(البته اختیار آپلود برای همه بسته شده بود!) و قالب جوملا رو + پسورد ادمین رو تغییر داده بودند.قالب و پسورد رو عوض کردم اما رموستری(مرکز دانلود) ارور زیر رو می ده
Internal Server Error

The server encountered an internal error or misconfiguration and was unable to complete your request.

Please contact the server administrator, [مهمان/کاربر گرامی برای دیدن لینک ها ابتدا باید عضو سایت شوید و لاگین کنید برای ثبت نام اینجا کلیک کنید] and inform them of the time the error occurred, and anything you might have done that may have caused the error.

More information about this error may be available in the server error log.

Additionally, a 404 Not Found error was encountered while trying to use an ErrorDocument to handle the request.

با توجه به اینکه تعداد فایلهای آپلودی من زیاده می خوام که ترمیمش کنم.البته توی خود ماژول تمامی فایلها و توضیحاتش هست.به هاست هم احتمالا دسترسی پیدا نکردن چون چیزی تغییر نکرده از تو هاست.اما پسورد مدیریت جوملا تغییر کرده بود.خواهش می کنم راهنمایی بفرمایید چطور درستش کنم؟آیا اگه به ورژن جدیدتر ارتقا بدم درست می شه؟اگر بله چطور باید اینکار رو انجام بدم؟