سلام
بهترین روش بک آپ استفاده از فول بک آپ هاست است، در غیر این صورت پیشنهاد میکنم تمام فایل های وب سایتتون رو به یک فایل فشرده زیپ تبدیل کنید و از طریق phpmyadmin از دیتا بیستون هم پشتیبان تهیه کنید.